@Francis, agnotologue

Le principe du « rasoir d’Ockhman » est un principe qui s’applique dans le domaine scientifique. L’explication la plus simple doit toujours être privilégiée. Albert Einstein a reformulé à sa façon ce principe : « on devrait tout rendre aussi simple que possible, mais pas plus ».

Dans le domaine de la virologie, c’est la complexité qui domine. Au début des années 1970, la « transcriptase inverse » est « découverte ». Elle permet d’expliquer comment les « virus » transforment l’ARN en ADN. Jusqu’à ce moment cette idée n’était pas acceptée. La découverte de la « transcriptase inverse » permettait d’expliquer la théorie de la réplication virale, bien que celle ci ne fût jamais observée in vivo.

Lorsque la « transcriptase inverse » a été découverte« , ou, plus exactement, la théorie de la transcription inverse, les vésicules extra cellulaires et les exosomes n’étaient pas d’actualité. Depuis les années 1980 de très nombreuses recherches ont permis de définir leurs rôles physiologiques.
Les vésicules extra cellulaires et les exosomes jouent un rôle essentiel dans la communication intercellulaire. Ces petites vésicules, libérées par les cellules, peuvent transporter divers types de molécules et sont impliquées dans la régulation des réponses cellulaires, la modulation du système immunitaire, ainsi que dans la régénération et la réparation des tissus. Le fait que ces structures puissent contenir de l’ARN ou de l’ADN ne fait que renforcer l’idée que leur rôle pourrait expliquer les observations faites dans les cultures cellulaires.
Lorsque les cellules sont exposées à des stress, elles peuvent libérer des exosomes et des vésicules extra cellulaires qui transportent des fragments d’ADN ou d’ARN. Ces fragments génétiques sont perçus à tort comme provenant de »virus« , mais, en réalité, ils sont simplement issus de processus normaux de communication cellulaire et non de réplication virale. Ce phénomène explique l’apparente présence de matériel génétique dans les cultures, sans avoir recours à l’idée de »virus".
L’apoptose des cellules (la mort cellulaire) en culture, et même le stress cellulaire, entraîne le relargage de ces vésicules. Ces structures peuvent contenir des ARN messagers, des miARN, des protéines, et des fragment d’ADN, ce qui est, à tort, interprété comme une forme d’infection virale dans les cultures.

Un énorme travail scientifique a été réalisé sur les vésicules extra cellulaires et les exosomes et les études, toujours plus nombreuses, se poursuivent. Mais la virologie n’a pas encore intégré dans ses démarches l’existence des vésicules extra cellulaires et des exosomes. La virologie classique est principalement centrée sur l’idée que les virus sont des agents pathogènes autonomes, distincts des cellules hôtes, qui infiltrent les cellules pour se répliquer et provoquer une infection. Cette vision ne prend pas en compte la possibilité que les vésicules extracellulaires puissent jouer un rôle similaire dans la transmission ou la propagation de matériel génétique. En conséquence, les fragments d’ADN ou d’ARN détectés dans les cultures cellulaires sont souvent attribués à une origine virale, sans qu’une investigation plus approfondie sur leur source réelle (cellulaire ou virale) ne soit effectuée. 
La virologie ne prend pas en considération les effets du stress cellulaire, y compris ceux induits par les antibiotiques, les agents pathogènes, ou même les conditions de culture non physiologiques. Or, ces facteurs de stress induisent la production de vésicules extracellulaires.
Lorsque des fragments d’ADN ou d’ARN sont retrouvés dans les cultures, ils pourraient aussi bien être issus de la cellule hôte, ou même être le résultat de mécanismes de défense contre des agents pathogènes ou de l’inflammation.

En négligeant ces mécanismes naturels de communication et de défense, pourtant parfaitement bien identifiés scientifiquement, la virologie tend à réduire les phénomènes observés à des interactions simplistes entre des virus et la cellule, sans chercher à comprendre les réponses complexes de la cellule. Le principe du rasoir d’Ockhman doit s’appliquer aussi à la virologie tout autant que la rigueur scientifique !